Обратил внимание что после одного из обновлений у DBeaver пропала иконка на панели задач. Решается вот так..
Открываем в любимом редакторе файл ~/.local/share/applications/dbeaver.desktop
Видим примерно такое содержимое
[Desktop Entry]
Categories=IDE;Development
Comment[en_US]=Universal Database Manager and SQL Client.
Comment=Universal Database Manager and SQL Client.
Exec=nice -n 10 /usr/share/dbeaver/dbeaver
GenericName[en_US]=UniversaL Database Manager
GenericName=UniversaL Database Manager
Icon=/usr/share/dbeaver/dbeaver.png
Keywords=Database;SQL;IDE;JDBC;ODBC;MySQL;PostgreSQL;Oracle;DB2;MariaDB
...
Нас интересует строчка
Icon=/usr/share/dbeaver/dbeaver.png
Проверяем существует ли иконка и видим что ее нет
$ ls /usr/share/dbeaver/dbeaver.png
ls: cannot access '/usr/share/dbeaver/dbeaver.png': No such file or directory
Можно просто по этому пути положить нужную иконку и проблема будет решена, но я пошел другим путем. Открываем папку /usr/share/applications/
Находим там похожий ярлык dbeaver-ce.desktop у которого с иконкой все ок. Открываем его в редакторе и копируем путь к иконке, в тот файл что лежит у вас. У меня новый путь вот такой
Icon=/usr/share/dbeaver-ce/dbeaver.png
В моем случае иконка подтянулась сразу, даже не пришлось перезагружать Dbeaver