Сделал экспорт GUI проекта в jar файл, и по двойному клику по нему получал ошибки запуска. Но при запуске через консоль все работало прекрасно. Конечно через консоль совсем не удобно запускать и создавать постоянно bat файлы так же не охота. Поэтому я решил пофиксить это.